【佳學(xué)基因檢測】MassARRAY SNP基因型技術(shù)———正確的基因序列獲取+基因解碼!

佳學(xué)基因MassARRAY SNP基因型技術(shù)———正確的基因序列獲取+基因解碼!

佳學(xué)基因MassArray分型技術(shù)

 

MassARRAYSNP基因分型技術(shù)是由美國Agena Bioscience, Inc.開發(fā)的一種新型DNA序列獲取技術(shù)。Agena Bioscience, Inc.原名為Sequenom Bioscience Division，位于美國圣地亞哥，與佳學(xué)基因創(chuàng)始人黃家學(xué)博士曾經(jīng)工作過的諾華制藥基因組學(xué)研究中心毗鄰。2005年至2008年之間正是Sequnenom公司大力發(fā)發(fā)展的公司。黃家學(xué)博士和Squenom的科學(xué)家保持密切的溝通和探討。并及時(shí)將其引入中國，開發(fā)了極具競爭爭力的基因檢測產(chǎn)品。

佳學(xué)基因MassArraySNP分型平臺通過PCR擴(kuò)增跨越SNP位點(diǎn)的DNA序列，然后應(yīng)用單一延伸引物(extension primer)擴(kuò)增PCR產(chǎn)物，確保延伸引物只延長一個(gè)堿基。延伸產(chǎn)物用飛行質(zhì)譜(TOF, time of flight)進(jìn)行分析，根據(jù)一個(gè)堿基的分子量差別對SNP進(jìn)行分型，也可做SNP位點(diǎn)等位基因頻率計(jì)算。MassARRAY SNP基因型分析可以進(jìn)行多重SNP分型，即一個(gè)反應(yīng)可同時(shí)分型多個(gè)SNP位點(diǎn)。該技術(shù)分析正確，在分析數(shù)十至上百個(gè)SNP時(shí)具有價(jià)格優(yōu)勢。

佳學(xué)基因MassArray技術(shù)的先進(jìn)性

 

MassARRAY飛行質(zhì)譜檢測系統(tǒng)基本原理為基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS) 技術(shù)。將制備好的樣品與芯片基質(zhì)共結(jié)晶，將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管，而后用瞬時(shí)納秒 (10^-9s) 強(qiáng)激光激發(fā)，由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量，導(dǎo)致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱，從而使基質(zhì)晶體升華，核酸分子就會(huì)解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子，產(chǎn)生的離子多為單電荷離子，這些單電荷離子在加速電場中獲得相同的動(dòng)能，進(jìn)而在一非電場漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率加以分離，在真空小管中飛行到達(dá)檢測器，飛行時(shí)間與離子質(zhì)量成正比。MALDI產(chǎn)生的離子用飛行時(shí)間（Time-of-Flight,TOF）檢測器來檢測，離子質(zhì)量越小，飛行時(shí)間越短。理論上講，只要飛行管長度足夠，TOF 檢測器可檢測分子的質(zhì)量數(shù)是沒有上限的。

 
圖1 飛行時(shí)間質(zhì)譜檢測物質(zhì)分子量的原理

佳學(xué)基因MassArray技術(shù)的應(yīng)用

 

MassARRAY SNP基因型分析在生物科學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)研究和應(yīng)用等多個(gè)領(lǐng)域具有非常好的應(yīng)用前景，為全世界的科學(xué)家們提供優(yōu)質(zhì)的解決方案，獲得了矚目的進(jìn)展。以下是一些代表文獻(xiàn)：

技術(shù)特點(diǎn)

設(shè)備儀器

 
圖2 MassARRAY Genetic Analysis System平臺示意圖

樣品類型

價(jià)格

SNP分型（或基因突變檢測）的費(fèi)用根據(jù)需要分型的SNP位點(diǎn)，數(shù)目以及樣品數(shù)量的不同而制定。

提交數(shù)據(jù)

分型結(jié)果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飛行質(zhì)譜分析圖：

 
圖3 MassARRAY-SNP基因分型飛行質(zhì)譜部分分析圖

 

• 上一篇：【佳學(xué)基因檢測】臨床遺傳病NGS基因檢測標(biāo)準(zhǔn)
• 下一篇：【佳學(xué)基因檢測】基因檢測儀器介紹:ABI 3130測序儀

• 收藏
• 挑錯(cuò)
• 推薦
• 打印