【佳學(xué)基因檢測】自閉癥基因檢測與常見的單核苷酸多態(tài)性

等位基因單核苷酸多態(tài)性（SNP）的基因信息基礎(chǔ)

在我們關(guān)注人類差異的過程中，很容易忽視人類之間巨大的基因相似性。人類基因組測序在21世紀(jì)初完成，結(jié)果發(fā)現(xiàn)人類約99.5%相同。盡管如此相似，整個(gè)學(xué)科，如CSD，圍繞著個(gè)體差異的研究如雨后春筍般涌現(xiàn)，從基因信息的角度來看，這是由人類基因中不到0.5%基因序列引起的。

令人感興趣的是，人類的所有基因的變化形式都是從“突變”開始的，也就是DNA合成中的“錯(cuò)誤”，例如在鳥嘌呤的地方了插入腺嘌呤。幾十萬年來，選擇作用于具有突變的個(gè)體。如果它們能夠繁殖，突變個(gè)體的數(shù)量就會(huì)增加。這種等位基因變異導(dǎo)致了眼睛顏色、血型和咖啡因代謝速度等方面的差異。從語義上講，一旦1%或更多的人群發(fā)生了特定的突變，該突變就被命名為“變體”或“多態(tài)性”。換言之，昨天的變異已經(jīng)成為今天的常見變異。

佳學(xué)基因在上一篇文章中重點(diǎn)討論了可以導(dǎo)致疾病癥狀產(chǎn)生的不常見突變，這里重點(diǎn)要討論的是被認(rèn)為與許多其他遺傳和環(huán)境因素共同導(dǎo)致自閉癥疾病癥狀出現(xiàn)的的常見等位基因變異。人類中這種常見的遺傳變異在遺傳學(xué)文獻(xiàn)中經(jīng)常被稱為單核苷酸多態(tài)性，或者是簡單的稱之為SNP（發(fā)音為“snips”）。據(jù)佳學(xué)基因統(tǒng)計(jì)，在人體基因組中，每300-1000個(gè)堿基中（A、C、G或T）中就有一個(gè)SNP；總之，SNP是一種小的遺傳差異，不被視為突變，因?yàn)樗鼈冊(cè)谌巳褐械念l率相對(duì)較高，并且缺乏相關(guān)的癥狀學(xué)，至少在單獨(dú)存在時(shí)，不會(huì)導(dǎo)致癥狀的出現(xiàn)。

單核苷酸多態(tài)性與自閉癥基因檢測的相關(guān)性

通過一項(xiàng)稱為全基因組關(guān)聯(lián)研究（簡稱GWAS）的基因解碼方法，發(fā)現(xiàn)大量SNP與自閉癥相關(guān)。具體而言，該研究方法比較了大量個(gè)體中SNP的存在頻率，包括有自閉癥的和沒有自閉癥的。與非孤獨(dú)癥對(duì)照組相比，在孤獨(dú)癥患者中常見的基因序列變化為孤獨(dú)癥表型的基因原因提供了各種可能的解釋。盡管這類研究可能具有作用，但這些關(guān)聯(lián)不一定是因果關(guān)系，當(dāng)自閉癥和非自閉癥群體之間的種族背景等關(guān)鍵因素沒有受到很好的控制的話。

將孤獨(dú)癥與一些常見的變異聯(lián)系起來，有助于解釋孤獨(dú)癥在家庭中聚集的趨勢。事實(shí)上，據(jù)報(bào)道，在沒有確定遺傳綜合征的孤獨(dú)癥兒童的兄弟姐妹中，再有一個(gè)孤獨(dú)癥孩子的幾率估計(jì)為18.7%，這可能是因它們有共同的基因和家庭環(huán)境。相反，如果是生殖細(xì)胞中出現(xiàn)的新突變導(dǎo)致的自閉癥，無論是通過DNA復(fù)制還是重組，都不太可能再次發(fā)生，在這種情況下，再生下另一個(gè)自閉癥孩子的可能性與普通人群相似。

對(duì)自閉癥患者進(jìn)行常見變異的基因檢測

與單基因自閉癥不同，沒有任何主流醫(yī)學(xué)基因檢測明確關(guān)注與自閉癥相關(guān)的常見變異（即SNP）。但是佳學(xué)基因已經(jīng)開發(fā)并銷售了一種基因基因檢測，即自閉癥風(fēng)險(xiǎn)基因檢測，該測試?yán)脧目谇皇米又蝎@得的DNA有意篩選出大量與自閉癥相關(guān)的常見變異。該基因檢測正在市場上推廣，作為一種手段，用于在出生后確定“有發(fā)育遲緩跡象、臨床懷疑患有自閉癥或先前診斷患有自閉癥的年長兄弟姐妹的兒童患自閉癥譜系障礙的風(fēng)險(xiǎn)”?；蚪Y(jié)果旨在與臨床評(píng)估一起使用，特別是針對(duì)48個(gè)月或以下的兒童，不可用于產(chǎn)前檢測。特別是考慮到與該測試相關(guān)的低靈敏度，很難想象該測試的實(shí)用性。然而，考慮到基因檢測的廣泛使用，未來很可能會(huì)有類似的檢測。