【佳學基因檢測】精神分裂癥基因檢測如何提高疾病診斷的準確性?
需不需要告訴孩子的精神分裂癥基因檢測結果?
現代基因組技術,如DNA片段的下一代測序(NGS),為我們提供了深入了解基因組信息的新方法。這些技術可以幫助我們解碼基因,找到潛在的遺傳變異。然而,盡管這些技術能夠識別出成千上萬的基因變異,但它們如何準確地用于診斷和治療還沒有明確的標準。
相比于90年代人類基因組計劃的熱情,許多醫(yī)生和患者對遺傳學的理解仍然不夠清晰。特別是在預測精神疾病的遺傳檢測方面,許多人擔心這些檢測結果可能帶來的影響,包括尊嚴、歧視、創(chuàng)傷和社會恥辱。由于難以準確預測基因變異對疾病的實際影響,很多患者和機構對精神分裂癥的基因檢測持保留態(tài)度。
雖然NGS技術可以識別大量的基因變異,并揭示整個基因組,但如果沒有相應的基因解碼技術,我們很難將這些發(fā)現與復雜的精神和神經特征聯系起來。這使得心理和精神健康的基因信息可能被誤解或濫用,從而導致社會歧視。
在實際應用中,由于基因和環(huán)境因素的復雜互動,預測基因型的表現結果依然困難。因此,基因檢測的結果可能在倫理上產生問題。與其他醫(yī)療領域不同,精神病學的基因檢測可能帶來更多的倫理問題,因為它涉及到社會規(guī)范和生物功能的雙重影響。例如,知道自己有高風險的精神分裂癥信息可能會增加患者的焦慮,從而導致更多的負面情緒。
倫理困境還體現在如何處理那些未經請求的或意義不大的基因發(fā)現上。在預后、長期病史、產前檢查和偶然發(fā)現等方面,如何解釋和披露這些信息是一個核心問題。許多人認為,應該告知患者那些對其健康有重要影響的信息,但也需要尊重患者的知情權。這一點在《歐洲人權與生物醫(yī)學公約》和聯合國教科文組織的《人類基因組宣言》中已有明確規(guī)定。
尤其是在處理兒童基因檢測結果時,挑戰(zhàn)更為復雜,尤其是涉及晚發(fā)性疾病如神經退行性疾病或癌癥。目前,對于如何處理這些結果尚無統(tǒng)一標準,倫理委員會也未給出明確答案。在這方面,專家委員會的建議和患者的選擇應該被充分考慮。
最終,在基因組檢測中,了解其優(yōu)勢、局限性和挑戰(zhàn)對于每位患者都至關重要。遺傳咨詢師在此過程中扮演了關鍵角色,他們需要為多學科護理團隊提供專業(yè)的指導,并在基因檢測前后為患者提供必要的咨詢。這可以幫助患者更好地理解檢測結果的含義,并明確他們對于未經請求的發(fā)現的偏好。
基因解碼采用內表型是否會簡化精神障礙的基因識別和基因檢測?
“內表型”是指是介于基因和疾病之間的性狀。內表型的概念反映了將精神疾病的復雜結構簡化的需求,并支持將精神病診斷提煉為基本要素的觀點,從而使基因分析和診斷更容易。內表型可以是任何類型的性狀,例如神經生理、認知、生化、神經影像或行為,這些性狀比疾病本身更基本,并且僅與少數基因相關。根據精神障礙基因解碼的說法,要將數量性狀視為內表型,“它必須與家族中的疾病共同分離,并且必須獨立于臨床狀態(tài)”。例如,脈沖前抑制(與FABP7、CHRNA7相關)和 P50 感覺門控的電生理缺陷或工作記憶下降(與RELN相關)被認為是精神分裂癥的中間特征。此外,與CACNA1C相關的面部情緒標記缺陷是 BD 中常見的內表型。為了了解精神分裂癥中定量內表型的分子背景,成立了精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS)。精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS)已啟動兩項進一步致病基因鑒定基因解碼。第一項致病基因鑒定基因解碼采用基于家庭的確定策略 (精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS)-1) 進行,44隨后進行了更大規(guī)模的病例對照確定致病基因鑒定基因解碼 (精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS)-2)。45兩種精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS) 策略都允許檢測到相似的內表型缺陷。從一組精神分裂癥患者、他們的兄弟姐妹和對照受試者中獲取的 15 項測量結果中,出現了五種不同的可遺傳神經認知因素,這些因素具有神經生物學、遺傳學和治療后果。這些因素的顯著遺傳性估計值范圍從 22%(情景記憶)到 39%(視覺抽象)。這五種內表型也可能有助于作為幾種相關精神障礙的主要 RDoC 認知測量。8計劃對大型 精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS)-2 隊列進行進一步調查,其中將進行旨在檢測與這些缺陷相關的變異的GWAS。將采用使用內表型排序、累積內表型負荷和基因負擔分析的新分析策略,以確定精神分裂癥中可遺傳缺陷的遺傳機制。另一個小組,明尼蘇達雙胞胎和家庭致病基因鑒定基因解碼中心 (MCTFR),對 4900 名個體進行了 GWAS,以揭示 17 種電生理內表型所涉及的遺傳因素。使用了大量遺傳方法,包括生物統(tǒng)計和遺傳遺傳力分析、GWAS、候選基因致病基因鑒定基因解碼、外顯子組中非同義 SNP 的稀有變異分析和 WGS。出乎意料的是,在 17 種特征中,有 8 種未檢測到相關基因。此外,與其他 9 種特征相關的基因與任何已知的大腦功能無關。這些發(fā)現并不排除這些特征的遺傳起源的可能性,但它們表明任何選定變異的影響都很小。酒精中毒遺傳學協(xié)作致病基因鑒定基因解碼( COGA) 獲得了更有希望的結果,將電生理內表型與臨床表型聯系起來。這項致病基因鑒定基因解碼已經確定GABRA2和CHRM2是增加酒精中毒風險的變異。在本致病基因鑒定基因解碼中,定量表型的使用大大增加了檢測遺傳決定因素的機會,并允許將廣泛的遺傳信號提煉成反映單個基因變異的更基本的成分。最近,精神分裂癥致病基因鑒定基因解碼成功地將內表型解構為復雜程度較低的突觸機制。使用依賴于 GABA 能中間神經元的果蠅嗅覺習慣模型,精神疾病致病基因鑒定基因解碼發(fā)現了蒼蠅模型與觀察到的與 GABA 能中間神經元功能障礙和感覺習慣受損相關的缺陷之間的相似性,這些缺陷構成了精神分裂癥中的內表型。果蠅模型用于了解影響 BLOC-1 直系同源亞基的果蠅功能喪失突變對突觸網絡的影響。精神疾病致病基因鑒定基因解碼解碼了精神分裂癥易感基因DYSB突變單獨或與DYSB網絡組件BLOS中的無效等位基因組合相關的表型。精神分裂癥基因解碼已經證明, DYSB或BLOS1功能喪失等位基因的純合子或復合雜合子會損害幼蟲神經肌肉接頭處的突觸結構和功能形態(tài),并損害果蠅的嗅覺習慣。此外,這項致病基因鑒定基因解碼還表明,由于存在無效BLOC-1突變,所檢查表型對基因劑量改變的敏感性存在差異。這些發(fā)現表明,內表型不僅僅是調控網絡中兩個或多個基因的附加效應的結果,旨在解構內表型的進一步致病基因鑒定基因解碼應該考慮整個復合體的不同組織水平。
令人驚訝的是,盡管經過了數十年的致病基因鑒定基因解碼,但關于內表型與精神障礙結構中的基因元素的相關性仍然存在許多困惑。理論上,內表型比 DSM 分類更簡單,其中一些確實如此。例如,COGA 致病基因鑒定基因解碼已成功將電生理內表型與易感基因聯系起來,而其他復雜性狀可能反映了許多影響較小的變體的作用,如 MCTFR 項目所證明的那樣,或可能代表連續(xù)譜。“簡單”內表型表現出從基因到表型的直接線性途徑,而“復雜”內表型則構成了復雜得多的生物模塊。部分基于數據庫比對的基因檢測人員認為“內表型的整個概念是有問題的”,應該重新考慮,尤其是“某些大腦現象比其他現象更簡單”的概念。用 EEG 測量的腦電波是否可以被認為比幾乎無法量化的個性更為根本?事實上,兩者都是整個大腦的功能。與精神病學亞型和分層的總體趨勢一致,有部分基因解碼研究人員提出,內表型可以進一步分解為其組成部分,從而提供具有更簡單遺傳結構的“內表型的內表型”,并且預計在分析中具有更高的信噪比。這種方法已成功應用于上述 Mullin等人的致病基因鑒定基因解碼中。為了進一步促進基因發(fā)現,已經提出了大量樣本,以及將結構與功能基因組學(例如,基因表達或表達數量性狀位點致病基因鑒定基因解碼)和表觀遺傳學聯系起來的多種遺傳方法,以增進對內表型遺傳結構的理解。最后,基因解碼將遺傳學致病基因鑒定基因解碼擴展到歐洲血統(tǒng)的個體之外,從而有可能提高發(fā)現至少具有中等效應大小的罕見變異的可能性。將內表型用作診斷工具的努力對未來的致病基因鑒定基因解碼提出了重大改進的思路。電生理學可能不是測量內表型的最佳方法。還有許多其他候選內表型,例如神經影像學,它們可能與潛在的遺傳學更相似,因此有望識別表型并作為遺傳標記和疾病之間的中間特征?;蛘撸梢越M合不同的多模態(tài)表型模式來增強分析性能,類似于成功應用于阿爾茨海默病?迄今為止,內表型的識別尚未導致精神疾病新風險變異的重要發(fā)現,盡管結構越復雜,就越有必要簡化和總結核心成分以理解它們。這就是為什么精神分裂癥的致病基因鑒定和個性化治療基因檢測不應該放棄整體戰(zhàn)略。
致病基因鑒定基因解碼如何更精細地解構精神分裂癥的致病基因,增加檢測準確性?
內表型的概念及其重要性
“內表型”指的是介于基因和疾病之間的某種性狀。它們是更基礎的特征,比疾病本身更接近基因,并且通常與少數基因有關。例如,內表型可以是神經生理、認知、行為等方面的特征。利用內表型,可以簡化精神疾病的復雜結構,使基因分析和診斷更加明確。
如何利用內表型解構精神分裂癥
在精神分裂癥的研究中,內表型幫助科學家們更細致地了解疾病的遺傳基礎。傳統(tǒng)上,基因和疾病之間的關系非常復雜,使得直接研究基因與精神分裂癥的關系變得困難。而通過分析內表型,研究人員可以找到與精神分裂癥相關的更基礎的生物標志物,從而更精確地解構疾病的遺傳機制。
具體的研究方法和發(fā)現
內表型的研究:例如,脈沖前抑制和P50感覺門控電生理缺陷,工作記憶下降等,都被認為是精神分裂癥的內表型。這些特征能夠與精神分裂癥的遺傳因素聯系起來,因為它們通常與特定基因相關,如FABP7、CHRNA7、RELN等。
精神分裂癥內表型遺傳學聯盟 (COGS):COGS項目通過兩個階段的研究,首先是基于家庭的策略(COGS-1),然后是大規(guī)模病例對照研究(COGS-2),旨在識別與內表型缺陷相關的遺傳變異。通過分析患者及其家屬的內表型數據,發(fā)現了五種不同的神經認知因素,這些因素在遺傳學上表現出顯著的相關性。這些因素的遺傳性估計從22%到39%不等,顯示了內表型在精神分裂癥中的重要作用。
電生理內表型的遺傳研究:明尼蘇達雙胞胎和家庭致病基因鑒定基因解碼中心(MCTFR)對4900名個體進行了GWAS研究,揭示了17種電生理內表型的遺傳因素。盡管其中有8種特征未找到相關基因,但其他9種特征的遺傳信號仍然具有重要意義。
與其他疾病的比較:例如,酒精中毒遺傳學協(xié)作(COGA)項目發(fā)現GABRA2和CHRM2基因與酒精中毒風險有關,表明通過內表型可以更有效地識別疾病的遺傳決定因素。
果蠅模型的應用:使用果蠅模型研究DYSB基因和BLOC-1復合體的影響,發(fā)現DYSB突變與精神分裂癥相關的內表型存在類似的缺陷。這些研究表明,內表型不僅僅是基因間相互作用的結果,也與特定的生物網絡和結構相關。
基因解碼利內表型解晰基因信息與疾病表征的關系,可以使精神分裂癥的基因檢測更準確
通過對內表型的研究,我們能夠更細致地解構精神分裂癥的遺傳基礎。這些基礎特征提供了與精神分裂癥相關的更直接的遺傳信號,使我們能夠更精準地識別致病基因,并為治療和預防提供了新的視角。這種方法不僅提高了對精神分裂癥遺傳機制的理解,也推動了相關領域的研究進展。
(責任編輯:佳學基因)