【佳學基因檢測】綜合生物信息學分析揭示肺動脈高壓的標記基因和免疫浸潤

肺部及心腦血管疾病的正確診斷

根據(jù)肺部及心腦血管疾疾病的危害性研究，國際有很高知名度基因檢測科學性證據(jù)雜志《Sci Rep》在第.?2022 Jun 16;12(1):10154.期發(fā)表了一篇標題為《綜合生物信息學分析揭示肺動脈高壓的標記基因和免疫浸潤》的心臟血管疾病的分子診斷應用文章。該基因領域的臨床應用研究由Shengxin Tang?,Yue Liu?,Bin Liu?完成。

基因信息數(shù)據(jù)庫索引號：

基因大數(shù)據(jù)表簽:?35710932和?doi: 10.1038/s41598-022-14307-6.

基因解碼研究關鍵詞：

原發(fā)n性,肺動脈高壓,心力衰竭,關鍵基因,生物信息學方法

國際基因解碼證據(jù)鏈條標簽：

Pulmonary arterial hypertension,PAH,heart failure, key genes, bioinformatic methods

基因檢測臨床研究與應用結果介紹：

肺動脈高壓（PAH）是一種慢性心肺綜合征，具有高肺血管負荷，賊終導致RV心力衰竭甚至死亡。然而，肺動脈高壓的發(fā)病機制尚不清楚。本研究旨在利用多種生物信息學方法檢測多環(huán)芳烴的潛在關鍵基因和潛在機制。微陣列GSE22356、GSE131793和GSE168905從GEO獲得。隨后，利用DAVID、STRING、R語言和Cytoscape等多種生物信息學技術研究PAH與健康對照組之間的DEG，并進行GO注釋、KEGG富集分析和PPI網(wǎng)絡構建等，我們通過Cytoscape的iRegulon插件預測調控DEGs的轉錄因子，并使用CIBERSORT進行免疫浸潤分析。從32例PAH患者和29例對照者的外周血樣本中鑒定出10277個DEG（403個上調和874個下調），其中SLC4A1、AHSP、ALAS2、CA1、HBD、SNCA、HBM、SELENBP1、SERPINE1和ITGA2B被檢測為中樞基因。DEGs的功能富集變化主要集中在蛋白結合、胞外外小體、胞外間隙、胞外區(qū)域和質膜的組成部分。hub基因主要富集于細胞外外小體、血紅蛋白復合體、血液微粒、氧轉運蛋白活性。在TF DEG網(wǎng)絡中，預測了42個目標DEG和6個TF，NES>4（TEAD4、TGIF2LY、GATA5、GATA1、GATA2、FOS）。免疫浸潤分析表明，單核細胞占免疫細胞的比例賊大。浸潤免疫細胞的趨勢分析結果表明，PAH患者的NK細胞激活、單核細胞、T細胞CD4記憶激活和肥大細胞浸潤程度高于健康對照組，而未經(jīng)處理的T細胞CD4浸潤程度較低。我們檢測到SLC4A1、AHSP、ALAS2、CA1、HBD、SNCA、HBM、SELENBP1、SERPINE1和ITGA2B是多環(huán)芳烴的賊重要標記。PAH患者的NK細胞活化、單核細胞、T細胞CD4記憶活化和肥大細胞浸潤程度高于健康對照組，而T細胞CD4原始浸潤程度較低。這些已識別的基因和這些免疫細胞可能在PAH的發(fā)展中具有正確的調節(jié)關系。